張弓教授主攻大規模測序領域，熟悉各種NGS平台，並自主開發了從底層分析到高級特化分析的一系列超高精度算法。

他建立了“翻譯組學”新領域，與基因組學，轉錄組學，蛋白質組學並列，使人類第一次能夠完整地銜接起生命的各個層次，從此對癌症和感染等重大疾病有了全新的視角，被人類蛋白質組組織（HUPO）稱為人類蛋白質組計劃的核心支柱之一。

僅最近五年就在“自然”等國際權威雜誌上發表高水平論文20餘篇。